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常振华，王世康，亐开兴，夏小婷，黄永震，雷初朝*（1.渭南职业技术学院，陕西渭南 714026；2.西北农林科技大学动物科技学院，陕西杨凌 712100；3.XX师范学院，云南XX 675000）郏县红牛是我国优良地方黄牛品种，主要分布于河南省平顶山市郏县、宝丰县和鲁山县，分布区域位于东经112°14～113°45、北纬33°08～34°20，属于暖温带大陆性季风气候。郏县红牛具有体格大、耐粗饲、适应性强、肉质红润细嫩等特点。但目前郏县红牛育种工作中仍存在诸多问题，如良种的保护与开发不足所导致种群数量逐年减少、品种生产水平较低等，需要通过现代育种原理与方法进一步选育提高与开发利用。动物Y 染色体常被作为研究动物父系遗传进化和亲缘关系的重要工具。种公牛对牛品种选育具有重要作用，因此需要分析其Y 染色体基因组遗传变异（主要是Y 染色体单拷贝区SNP）来研究家牛的起源。家牛Y染色体包括拟常染色体区（Pseudoautosomal Region，PAR）和雄性特异区（Male-Specific Region，MSY）。家牛MSY 区在减数分裂期间不与X 染色体重组。家牛MSY 区包含X-退化区……