税源管理联动机制，就是整合职能配置，整合数据应用，在各级部门之间，上下层级之间以及税源税基管理的主要环节之间，建立起职责清晰、衔接顺畅、重点突出、良性互动的管理机制。税源管理联动机制能够有效地整合现有资源，形成税源管理的合力，提高税收征管质量。税源管理联动机制作用的有效发挥，需要部门与部门之间密切配合，特别是各业务部门之间的密切配合。但是，由于受机构设置不尽合理，管理职责存在交叉现象，各部门之间信息传递不畅等因素影响，部门与部门之间的衔接存在一定的脱节现象，影响了税源管理联动机制作用的充分发挥。如何理顺部门与部门之间的关系，建立顺畅的部门协作机制，对于充分发挥税源管理联动机制作用，深化税源管理具有重要意义。
　　一、当前税源联动管理中部门协作存在的问题
　　一是机构设置不合理，部门分工不明、职责不清。自从实行征、管、查机构三分离改革以来，各级都按照征、管、查机构三分离原则，设置了相应的机构。但是，这些机构职能划分不够清晰，分工不尽合理，如不少税务机关就存在管理部门和稽查部门检查权限划分不够明确，征收部门和管理部门共同行使个体户日常管理和税款征收权现象，甚至出现多个部门都有权管理同一事情，且不同部门在处理同一问题时意见各异，造成纳税人左右为难，不知听谁为好，严重影响税收执法的严肃性。

　　二是部门配合不力，工作衔接不畅。目前，部门之间如何协作，缺少一整套行之有效的工作衔接制度，如对征收部门如何根据管理部门的纳税评估和稽查部门的稽查结论征收税款，以及收缴滞纳金和罚款，其征收情况如何通知管理部门、稽查部门；管理部门如何根据征收部门的征收情况和稽查部门的稽查情况实施管理，其管理情况如何告知征收部门、稽查部门；稽查部门如何根据征收部门的征收情况和管理部门的管理