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DNA甲基化与个体年龄的相关性研究进展

栏目:医学论文发布:2009-03-27浏览:2601下载130次收藏
【摘 要】年龄推断在法医实践中占有重要的地位。分子生物学的巨大进展使得人们借助于生物学标记推断个体年
龄成为可能。作为表观遗传学重要组成部分的dna甲基化,在机体生长、发育、衰老的过程中存在着动态变化过程.通过
检测dna甲基化改变,有望构建与之相关的年龄变化模式,用以推断个体年龄。本文着重介绍dna甲基化水平的改变与
个体年龄的相关性及其在判断个体年龄方面的前景。
【关键词】法医物证;dna甲基化;年龄推断;生物体衰老
【中图分类号】d9l9.2
【文献标识码】a
【文章编号】1007—9297(2006)04—0284—05
当前在法医学实践中,对个体年龄的推断主要是
依据人类学方法测量骨骼、牙齿等一些具有年龄相关
性的检材.并根据相关模型进行计算。分子生物学的
飞速发展,开拓了人们的视野。借助于分子生物学理
论和方法.在细胞水平、分子水平发现一些可能与年
龄相关的遗传学改变,如dna损伤修复能力、端粒的
长度、线粒体片段的缺失、dna甲基化水平、b一半乳糖
苷酶活性以及基因表达谱等。lll dna甲基化是表观遗
传学(epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞
功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重
要作用.在衰老的过程中某些细胞会发生年龄相关的
变化,121例如某个cpg岛的从头甲基化会关闭一个基
因,使这个基因相关的生理功能丧失:同样。甲基化的
丢失也会激活正常情况下沉默的基因.造成不恰当的
异位表达(ectopic )。必须指出,表观遗传研
究丝毫没有降低遗传学或基因组学的重要性,恰恰相
反,表观遗传学是在以孟德尔式遗传为理论基石的经
典遗传学和分子遗传学母体中孕育的专门研究基因功
能实现的一种特殊机制的遗传学分支学科。认识到表
观基因组在发育、生长和衰老过程中存在着一个动态
变化的过程,以及体细胞的表观基因组有重新编程的
可能性,有助于我们以新的观点来探索衰老的机制,构
建年龄变化的模式。本文就dna甲基化与个体年龄的
相关性及其在判断个体年龄方面的前景进行探讨。

、概述
(一)表观遗传学和dna甲基化
遗传学是与表观遗传学(genetic)相对应的概念。
遗传学是指基于基因序列改变所致基因表达水平变
化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等;而
表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表
达水平变化,如dna甲基化和染色质构象变化等:表
观基因组学(epigenomics)~0是在基因组水平上对表观
遗传学改变的研究。甲基化是最重要的表观遗传修饰
形式。dna甲基化是生物体在dna甲基化转移酶
(dnmts)的作用下,以s一腺苷酰一l一甲硫氨酸(sam)
为甲基供体,将甲基转移到特定碱基上去的过程,
dna甲基化多发生在胞嘧啶,大多在一cpg一序列上。
胞嘧啶由此被修饰为5甲基胞嘧啶(5-methylcytosine.
5-mc)。这种dna修饰方式并没有改变基因序列。但
它调控了基因的表达。
哺乳动物中.cpg序列在基因组中出现的频率仅
有l%,远低于基因组中的其他核苷酸序列。但在基因
组的某些区域中,cpg序列密度很高,可以达均值的5
倍以上,成为鸟嘌呤和胞嘧啶的富集区.形成所谓
cpg岛。通常cpg岛大约含有500多个碱基。在哺乳
动物基因组中约有4万个cpg岛,而且只有cpg岛
的胞嘧啶能够被甲基化,cpg岛通常位于基因的启动
子区或是第一个外显子区 。人类基因组中大小为
100~l 000 bp左右且富含cpg二核苷酸的cpg岛总
是处于未甲基化状态.并且与56%的人类基因组编码
基因相关。人类基因组序列草图分析结果表明,人类
基因组cpg岛约为45 000个.大部分染色体每1 mb
就有5—15个cpg岛。平均值为每mb含lo.5个cpg
岛,cpg岛的数目与基因密度有良好的对应关系。健
康人基因组中.cpg岛中的cpg位点通常是处于非甲
基化状态,而在cpg岛外的cpg位点则通常足甲基化的。这种
甲基化的形式在细胞分裂的过程中能够稳定的保留。阁基因
调控元件(如启动子)所含cpg岛中的5-mc会阻碍
[作者简介]李鑫(1974一),男,山东淄博人,主检法医师,硕士研究生,主要从事法医遗传学研究。
法律与医学杂志2006年第l3卷(第4期)
转录因子复合体与dna的结合,所以dna甲基化一
般与基因沉默(gene silence)相关联;而去甲基化
(demethylation)往往与一个沉默基因的重新激活(re.
activation)相关联。当机体衰老或呈病理状态,特别是
肿瘤发生时,抑癌基因cpg岛以外的cpg序列非甲
基化程度增加,而cpg岛中的cpg则呈高度甲基化,
以至于染色体螺旋程度增加及抑癌基因表达的丢失。
一般说来,dna的甲基化对维持染色体的结构、x染
色体的失活、基因印记和肿瘤的发生发展都起重要的
作用。【6】
(二)dna甲基化的生物作用及特点
1.dna甲基化与基因表达
dna甲基化在维持正常细胞功能、遗传印记、胚
胎发育过程以及衰老过程中起着极其重要的作用。研
究表明胚胎的正常发育得益于基因组dna适当的甲
基化。例如:缺少任何一种甲基转移酶对小鼠胚胎的
发育都是致死性的。[31此外,等位基因的抑制被印记控
制区(icrs)所调控,该区域在双亲中的一个等位基因
是甲基化的。17]印记基因的异常表达可以引发伴有突
变和表型缺陷的多种人类疾病。甲基化抑制基因转录
主要通过以下机制来实现。
(1)直接抑制。cpg岛甲基化真接干扰tf与调控
区dna 的结合. 例如camp反应元件结合蛋白
(creb),ap一2,e2f,nfkb等tf不能与相应的dna
位点相结合。但有些tf如sp1,ctf与甲基化和非甲
基化位点都能结合,这表明甲基化单独不足以阻止体
内tf与dna相结合。
(2)间接机制。近年来发现一些甲基化dna结合
蛋白如mdbp1,mdb2以及甲基化cpg结合蛋白如
mecp1,mecp2与甲基化dna特异结合,抑制基因转
录。其介导转录抑制的程度取决于甲基化密度和启动
子的强度。如低密度甲基化可完全抑制一些弱的启动
子,但对强的启动子则收效甚微。
(3)dna甲基化还可通过影响染色体结构来抑制
转录。不仅甲基化启动子区形成的核小体抑制体外起
始转录,而且mecp1与甲基化启动子cpg位点结合
后,可引起染色质聚缩成非活性高级结构,以至于转
录因子不能与其相结合,从而抑制转录。
dna甲基化状态并非固定不变.在许多哺乳动物
组织内,基因组甲基脱氧胞嘧啶水平随老化而下降,
在鲑鱼、小鼠、大鼠、牛与人类的脑、肝脏、大肠粘膜、
心脏和脾脏内发现dna脱甲基化作用。相反,大鼠肺
则不发生脱甲基化,大鼠。肾内甲基脱氧胞苷总含量增
加。这说明甲基化状态随老化而变化,即发生甲基化
· 285 ·
和脱甲基化,但总的说来,最常见的变化似乎是进行
性的脱甲基化。这些变化均可导致随老化而发生的基
因表达变化。
2.dna甲基化与肿瘤的关系
研究表明,dna甲基化在肿瘤的发生、发展中起
重要作用。甲基化状态的改变是引起肿瘤的一个重要
因素,这种变化包括dna甲基化总体水平降低和启
动子等基因表达调控元件附近的cpg岛局部甲基化
水平的异常
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