首先是股金分红有关政策执行难。
　　第一是当年亏损的联社股金不能分红的政策难以执行。银监会《关于规范向农村合作金融机构入股的若干意见》（银监发[2004]23号）规定，当年亏损的农村合作金融机构不得对社员（股东）分配红利，但是可以通过财政补贴资金解决分红问题。如湖北省农村信用社预计2005年底还有40个联社亏损，其股金42亿元，按3%的分红率计算，需分红资金12600万元，但省政府拨付的分红补贴仅6000万元，缺口有6600万元，占分红资金总额的52.4%。二是当年盈利但历年亏损大的农村信用社股金分红政策难以执行。银监会《关于规范向农村合作金融机构入股的若干意见》（银监发[2004]23号）规定，当年盈利的农村信用社，在未全部弥补历年亏损挂账或资本充足率未达到规定要求前，其红利分配原则上应采用转增股金方式，不得分配现金红利。截止2004年末，湖北省84家县级联社中，无历年亏损的仅4家，占4.7 %，其余均为亏损。股民要求现金分红的愿望强烈，若采取转增股金方式，股民将会有很大的抵触情绪。
票据按期兑付难。
　　 人总行和银监会联合下发的《中国人民银行、中国银监会会进一步加强农村信用社改革试点专项中央银行票据发行兑付考核工作的通知》（银发[2005]112号），就票据的发行和兑付标准，除了对资本充足率和不良贷款降比有指标要求[本文来源于大秘书-www,damishu.com,找范文请到大秘书网]外，还对成本费用支出、盈利能力、法人治理结构等有具体的规定。相对先期试点的8个省市而言，票据的发行和兑付门槛抬高了很多。同时，人总行对分支行关于票据发行和兑付的申报材料的质量将进行严格考核，导致人民银行分支行要求县联社分批次申请发行和兑付票据，使得部分符合条件的县联社不能及时申请和兑付票据。
产权模式向更高层次发展难。
　　 银监会最近下发的《农村合作银行监管工作意见》，对组建农村合作银行又实行了新的标准：一是不良